SubAuditorat I
1. Gubernur
2. DPRD Provinsi
3. Sekretariat Daerah
4. Sekretariat Dewan
5. BPKAD
6. Inspektorat
7. Dinas Damkar dan Penanggulangan Bencana
8. Dinas Kominfo dan Kehumasan
9. BKD
10.Bappeda
11.Badan Kesbangpol
12.Kotif 5 Wilayah
13.Kabtif Pulau Seribu
14.Kecamatan
15.Kelurahan
16.Satpol PP
17.Badan Pengelola Pajak dan Retribusi Daerah
18.Dinas PTSP
19.Dinas Sosial
20.Dinas Pemberdayaan Masyarakat, Perempuan dan Keluarga Berencana
21.Disnakertrans
Subauditorat II
1. Dinas Pendidikan
2. Dinas Olah Raga dan Pemuda
3. Dinas Parbud
4. Dinas Kesehatan
5. Dinas KUKM dan Perdagangan
6. Dinas Perindustrian dan Energi beserta UPT-nya
7. Dinas Kelautan dan Pertanian beserta UPT-nya
8. Dinas Dukcapil
9. Badan Penanaman Modal dan Promosi
10.Badiklat
11.Badan Perpustakaan dan Arsip Daerah
12.RSUD dan Puskesmas
13.RSKD
14.Dinas Pertamanan dan Pemakaman
15.Dinas Kebersihan
16.Dinas Bina Marga
17.Dinas Tata Air
18.Dinas Perumahan dan Gedung Pemda
19.Dinas Pengelolaan Lingkungan Hidup
20.Dinas Tata Ruang dan Pertanahan
21.Dinas Pengawasan dan Penertiban Bangunan
Subauditorat III
1. BLUD Transjakarta
2. PT Jakarta Propertindo
3. PT Pembangunan Jaya Ancol
4. PT Jakarta Industrial Estate
5. PT Pembangunan Sarana Jaya
6. PD Pasar Jaya
7. PT Bank DKI
8. PDAM Jaya
9. PD Dharma Jaya
10.PT Food Station Tjipinang
11.Jakarta Toursindo
12.BP THR Lokasari
13.PD PAL Jaya
14.Dinas Perhubungan dan BLUD-nya
15.UPT Pengelolaan Perparkiran
16.PT MRT